在地学方面，沈括也作出了不少贡献，熙宁七年（1074年）四月，他到浙东察访，当他看到雁荡山山峰“峭拔险怪、上耸千尺、穹崖巨谷”的地貌景观时，认为这是流水侵蚀造成的，“原其理，当是为谷中大水冲激，沙土尽去，唯巨石岿然挺立耳”。对于西部黄土高原的“立土动及百尺，迥然耸立”的地貌，他认为也是水流冲积所致。后来他到河北巡察，在太行山区发现“螺蚌壳及石子如鸟卵者，横亘石壁如带”，推断出“此乃昔之海滨”。之所以成为现在的大平原，原因在于“皆浊泥所湮耳”。[20]此外，沈括还发明了用木屑、面糊堆捏地形，后改用蜡熔制作，形成了立体地图。其发明的立体地图法很快得以推广，“诏边州皆为木图，藏于内府”。[21]
在药物学方面，沈括的贡献在于：根据实物，对药物名存在的一物多名或多物一名的情况，作了详细的辨疑工作，修正了前人的一些错误。此外，他还非常注意收集验方，编有《良方》一书。在此书序中言：“予所谓良方者，必目睹其验，始著于篇，闻不预焉。”尤其是关于“秋石方”的记载，可以说这是世界上最早的荷尔蒙制剂的制备方法。
