哲布尊丹巴呼图克图,乃驻锡外蒙库伦佛教教主,亦为喀尔喀蒙古藏传佛教格鲁派最大的转世活佛。1614年,达赖喇嘛四世派遣觉囊派[33]僧多罗那他[34]至漠北弘法,被尊为“哲布尊丹巴”。1634年示寂,转世再来[35],受康熙封为呼图克图大喇嘛,即哲布尊丹巴一世。
哲布尊丹巴二世,曾创札尼特高等宗教学院[36]于库伦,一时僧侣云集,成为外蒙古政教中心和喇嘛教育圣地。其后历代转世,皆受清帝礼遇,至八世示寂为止,三百年间,具有外蒙古政治、宗教的领导权。光绪四年(1878年)后,清朝与外蒙古关系逐渐恶化[37],并削弱蒙古佛教势力。清灭亡后,哲布尊丹巴呼图克图于库伦独立,号“大蒙古国”。1915年6月,外蒙古取消独立,北京政府派遣使者前往库伦,封哲布尊丹巴为“外蒙古博克多哲布尊丹巴呼图克图汗”,政治上采自治方式,此时佛教极为兴盛。1924年,哲布尊丹巴八世示寂,外蒙古成为蒙古人民共和国,曾一度废除政教合一等。1931年,“蒙古人民革命党”第八届大会又决议采温和政策。